Name: Simulação de Dados de Experimentos de Mapping by Sequencing
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Author: Fabricio Araujo

portada Simulação de Dados de Experimentos de Mapping by Sequencing

Simulação de Dados de Experimentos de Mapping by Sequencing

Formato

Libro Físico

Autor

Fabricio Araujo

Encuadernación

Tapa Blanda

ISBN13

9783330771130

Categorías

Biología, ciencias de la vida

Simulação de Dados de Experimentos de Mapping by Sequencing

Fabricio Araujo (Autor) · · Tapa Blanda

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Reseña del libro "Simulação de Dados de Experimentos de Mapping by Sequencing"

Avanços recentes nas tecnologias de sequenciamento de nova geração (NGS) reduziram o tempo necessário para a identificação de mutações em genética forward, uma das principais formas para caracterização da função de genes em plantas. A metodologia utilizada para a identificação de mutações induzidas por agentes mutagênicos físicos ou químicos em uma população de mapeamento é conhecida como mapping-by-sequencing. Dentre as várias técnicas que utilizam esta metodologia, Next-generation mapping (NGM) ganha destaque por necessitar de um número pequeno de mutantes na população de mapeamento. Entretanto, nos trabalhos publicados, não fica claro o porquê da utilização dos parâmetros usados para formação da população de mapeamento (número de indivíduos, número de mutantes, forma de cruzamento) e para o sequenciamento (plataforma utilizada, método de sequenciamento, cobertura) nos experimentos. Por isso, desenvolveu-se um pipeline de bioinformática que possibilita a simulação de dados de experimentos que utilizam a técnica de NGM com a planta modelo Arabidopsis thaliana, uma das plantas mais estudas e sequenciadas na literatura.